В 2008 году прошла проверка выполнения инвестпрограмм развития электроэнергетической отрасли за 2007 год, в том числе в ОАО «РусГидро» (предыдущее название - ОАО «Федеральная гидрогенерирующая компания»). По результатам контрольного мероприятия отмечалось, что на многих ГЭС функционируют морально устаревшие и физически изношенные производственные фонды. При этом в стоимость работ по техническому перевооружению и реконструкции включаются мероприятия, не связанные с улучшением их технического состояния, в частности: обустройство территорий, создание музея, разработка логотипов и т.п.

4 сентября Коллегия Счетной палаты РФ под председательством Сергея Степашина приняла решение включить в План работы на 2010 год комплексную проверку целевого и эффективного использования предприятиями электроэнергетики инвестиционных средств, полученных в процессе реорганизации электроэнергетической отрасли, на техническое перевооружение, реконструкцию и модернизацию производственных фондов с целью обеспечения их энергобезопасности, а также анализ эффективности освоения ОАО «РусГидро» средств, выделенных на восстановление Саяно-Шушенской ГЭС.

На Коллегии были рассмотрены основные результаты проверок объектов гидроэнергетики, проведенных Счетной палатой ранее, о которых сказано выше. Материалы контрольных мероприятий в свое время были рассмотрены в профильной Комиссии Совета Федерации Федерального Собрания Российской Федерации, а также направлялись в Генеральную прокуратуру Российской Федерации.